La taxonomie , dans les sciences naturelles, est une classification universellement acceptée et scientifiquement pour distinguer tout ce qui vit et prospère à l'état sauvage.
Quiconque se passionne pour la collection sait à quel point il est important d'utiliser une méthode pour cataloguer les différentes pièces ou spécimens en sa possession. Il faut des règles univoques pour donner à tout un nom, un lieu et un ordre précis afin de toujours savoir distinguer tout dans son ensemble.
C'est exactement ce que fait la taxonomie : définir, ordonner et classer selon une hiérarchie claire tous les êtres vivants, y compris les êtres éteints et fossiles . C'est, en fait, une branche de la biologie qui attribue un «nom et prénom» scientifique aux organismes, un peu comme le bureau d'enregistrement le fait pour les gens.
Taxonomie: signification, hiérarchies et définitions
La classification des êtres vivants, comme mentionné, suit des niveaux hiérarchiques précis qui partent toujours de la définition du « royaume ».
Le royaume est donc le plus grand groupement qui comprend des phylums très différents. Oui, car selon Linné , chaque règne, à son tour, est divisé en phylums pour les animaux et en divisions pour les plantes et autres organismes . Les niveaux hiérarchiques comprennent:
- Classe: comprend de nombreux ordres, avec des caractéristiques communes (par exemple les mammifères).
- Ordre: comprend plusieurs familles avec des caractéristiques physiques communes.
- Famille: comprend plusieurs genres ayant des caractéristiques communes (par exemple, chat, lynx et lion)
- Genre: comprend des espèces très similaires qui peuvent s'accoupler mais pas produire de nouveaux organismes fertiles.
- Espèce: c'est la plus petite catégorie et comprend des organismes qui ont de nombreux caractères en commun. Seuls les organismes appartenant à la même espèce peuvent s'accoupler et générer une progéniture capable de se reproduire.
Aujourd'hui, la définition de « domaine» a été introduite comme un niveau supra-royal pour inclure également les bactéries et les archées . Parmi les subdivisions ultérieures qui ont surgi pour classer de nouvelles espèces dans des disciplines plus sectorielles, des termes tels que:
- superclasse
- super
- sous
- infraordini
- super et sous-familles
- tribu et sous-tribu.
En plus du rang des espèces, la taxonomie moderne comprend également des sous-rangs (par exemple, sous-espèces et races d' animaux ) et des variétés et des formes pour la botanique .
Taxonomie: étymologie du terme
Le terme « taxonomie » fait référence à la discipline qui étudie, ordonne et classe les éléments d'un système (biologique ou autre). Il dérive des mots grecs « taxis », qui signifie « ordre » et « nomos » qui signifie « règle ».
Pour cette raison, la taxonomie se préoccupe de donner un ordre aux êtres vivants qui composent la biosphère selon des règles précises. Un exemple concret de classification taxonomique linnéenne est celui relatif à l'être humain:
- Royaume: Animalia
- Phylum: Chordata
- Classe: Mammalia
- Ordre: Primates
- Famille: Hominidés
- Genre: Homo
- Espèce: Homo sapiens
Plus tard, nous verrons également la signification de ces termes pour mieux comprendre leur utilisation taxinomique. 
Taxonomie de Linné
Le système utilisé par Charles Linnaeus en 1700 pour classer les êtres vivants et les organiser selon une hiérarchie précise, représente encore aujourd'hui le plus important ouvrage de référence sur la nomenclature biologique .
Bien que le nombre de niveaux hiérarchiques envisagés par les sciences naturelles modernes se soit élargi au fil du temps, le travail du naturaliste suédois reste le seul reconnu par la communauté scientifique . Cela signifie que des siècles après sa première publication, chaque champ biologique continue d'être ordonné et classé selon la méthode taxonomique linnéenne .
L'ouvrage de Charles Linnaeus qui est aussi le manuel de référence de la taxonomie moderne est "Imperium Naturae". Dans cette première publication, Linné identifie pour la première fois les 3 Royaumes auxquels appartiennent les organismes vivants:
- Animal ( Animal Regnum)
- Légume (Regnum Vegetabile)
- Minéral (Regnum Lapideum)
L'extrême actualité de ce système nous fait comprendre la force et l'impact perturbateur que le travail de Linné a eu sur les sciences naturelles. Il est le fondement de la nomenclature biologique actuelle et a été perfectionné par les travaux ultérieurs du même naturaliste, en particulier «Species Plantarum» (1753, pour les plantes) et la dixième édition de «Systema Naturae» (publié en 1758).
Nomenclature binominale
Le plus grand mérite de Linné était d'avoir introduit la nomenclature binomiale en 1735 , basée sur le modèle aristotélicien et relative à la classification taxonomique des plantes, des animaux et des minéraux .
Grâce à cette méthode, chaque organisme est relié à deux noms qui sont le genre auquel il appartient (nomen genericum) et l' espèce (nom trivial ou nom spécifique).
Même aujourd'hui, le nom scientifique d'un être vivant ou éteint a une dérivation latine ou grecque, et est toujours composé de deux termes écrits en italique. Le premier terme représente le genre, le second identifie l'espèce (par exemple, Panthera leo est le lion et Panthera tigris est la panthère).
La méthode précédente consistait en une description simple, complètement arbitraire et dépourvue de toute exigence de systématisation et d'exactitude scientifique.
Taxonomie moderne
La méthode de Linné a été partiellement surmontée ou revisitée au cours des siècles. A l'époque de Linné , en effet, de nombreux organismes n'étaient même pas connus (par exemple les unicellulaires ) et un principe de classification prenant en compte les similitudes génétiques entre les différentes espèces était quasiment absent .
Pour cette raison, la taxonomie moderne envisage 6 domaines :
- eubactéries (Eubactéries)
- archées (archéobactéries)
- protistes (Protista)
- champignons (champignons)
- plantes (Plantae)
- animaux (Animalia)
Regroupés en 3 domaines :
- Les bactéries
- Archea
- Eukarya
Taxonomie animale
Le règne animal est celui dans lequel la méthode taxonomique de Linné est encore évidente aujourd'hui. Certains des noms attribués par le savant suédois aux animaux sont encore utilisés, même s'ils appartiennent à des groupes différents. En 1758, Linné divisa le règne animal en 6 classes :
- Mammalia
- Aves
- Amphibiens
- Poissons
- Insecta
- Vermes
Aujourd'hui, le règne animal tel que nous le connaissons est composé d'un très grand nombre d'organismes, tous différents les uns des autres. Les animaux vivants sont classés en une trentaine de phylums selon certains critères de classification:
- Nombre de couches de tissu embryonnaire;
- Organisation;
- Disposition des différentes parties du corps;
- Cavités corporelles présentes ou absentes;
- Développement à partir de l'œuf fécondé par l'adulte.
La taxonomie moderne comprend environ 1800000 espèces d'organismes , unies par des caractéristiques qui permettent une subdivision fondamentale en:
- Hétérotrophes (omnivores, herbivores, carnivores);
- Multicellulaire ;
- Eucaryotes .
Certains des représentants les plus distingués du règne animal
Des classes
- Porifera ou éponges : ce sont les animaux les plus anciens et les plus simples existant dans la nature. Ils se reproduisent à la fois de manière asexuée et sexuellement par fécondation interne.
- Coelentérés : avoir deux tissus (épiderme et gastroderma séparés par une couche gélatineuse (ex: méduse);
- Vers ou vers plats;
- Les mollusques ;
- Annélides : (par exemple vers de terre et sangsues);
- Arthropodes : ils se reproduisent par parthénogenèse;
- Échinodermes (oursins, concombres de mer, etc ...);
- Chordés (présence de queue);
- Vertébrés : caractérisés par une colonne vertébrale, un cordon nerveux et un crâne contenant le cerveau. Ils comprennent les poissons, les amphibiens, les reptiles, les oiseaux et les mammifères .
Taxonomie végétale
Le règne végétal comprend environ 350000 espèces qui se distinguent généralement par des termes génériques tels que arbres, herbes, fougères, buissons, ornements, vignes, mousses, etc.
La taxonomie moderne attribue les divisions suivantes au royaume des plantae :
- Charophyta
- Rhodophyta
- Chlorophyta
- Anthocérotophyte
- Bryophyta
- Marchantiophyta
- Ptéridophyta
- Psilophyta
- Lycopodiophyta
- Ginkgophyta
- Pinophyta
- Cycadophyta
- Gnetophyta
- Magnoliophyta
La plupart des plantes existantes sont classées dans le groupe des angiospermes (Magnoliophyta) qui comprend environ 250 000 espèces de plantes. Ils se caractérisent par la production de fleurs et la capacité de produire des fruits et des graines après la pollinisation .
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